徕卡生物显微镜的扫描图像的聚焦是靠调节末透镜的激励电流来实现的。调焦的实质是使电子束聚成的细束斑刚好落在样品面上。这样逐点扫描形成的像是情晰的。检查样品是否已调焦，应该采用高一档的放大倍数，并力求在图像中呈现出尽可能多的细节。
徕卡生物显微镜影响图像清晰度而可以设法校正的一种像差是保散。和徕卡生物显微镜透射电镜中一样，扫描电镜镜简的下部也装有一个消像散器。应该认真调节消像器才能保证得到好的图像。如果像散量过大消像散器的校正场已不足补偿其缺陷，就必须尽快清洗电镜的光路区，尤其是本透镜和末光阑部分。
徕卡显微镜的扫描电镜的主要功能是显示块状样品的表面形态。为使凹凸不平的样品表面能全域清晰成像，对扫描电镜的景深就有一定要求。扫描电镜中样品以下没有任何透镜，电子光学系统的焦深就是电镜允许样品清晰成像的景深。所以徕卡生物显微镜的焦深和景深这两个述语在这里可以任意运用。
备注：徕卡生物显微镜的聚焦系统部分文章由北京悦昌行科技有限公司编辑整理上传。