1．它以紫外光或紫单色光激发标本的荧光。因紫外光是不可见光，故由标本发出的荧光与背景反差很大。徕卡荧光显微镜通常是在黑暗的背景下观察彩色图像的，而普通显微镜是在亮的背景下观察较暗的样品的c荧光显微镜的对比度约为普通显微镜的100倍，因此可观察到用普通显微镜看不到的结构和细节。
2．用肉眼或普通显微镜观察经荧光色素染色的样品对，只可看到整个标本仅以同一颜色着色。而用徕卡荧光显微镜观察时，标本会发出染色色素特有的荧光．呈现出标本的彩色图像，易于鉴别，可减轻眼睛的疲劳。
3．用荧光色索染色，方法简单，制作标本容易．有利于快速工作。
4．用于染色的荧光色素只要很低的浓度(如1：100000)就能发出明亮的荧光，一般对机体无毒，故有利于活体观察，如研究功能器官的变化过程和细微结构．某些代谢过程的变化等等。
5．利用荧光还有助于分析物质的化学成分。例如，组织中有些重要成分能与药物起作用而发荧光，据此可鉴定它们的存在或定位。
照照明装置和观察显微镜之间的联结方式可分为分离型照明装置、配装闭合型照明装置、内装固定照明型显微镜3种类型。
在分离型中，照明装置与显微镜分开，可独立配置，如配合手持显微镜使用截止滤光片可直接观察荧光。该型制造简便，价格低，但若不小心碰撞，容易使光轴不重合，造成偏位，调整较困难，而刀在照明装置与显微镜之间易有紫外线泄漏至光路之外。用于荧光抗体法时，若亮度不充分，光轴的少量偏位就会妨害观察，使用时应格外注意。
配装闭合型中，徕卡显微镜装置在照明装置的底座上，显微镜固定于底座，所以比分离型易调整光轴，稳定性好。但其灵活性差，不使用于手持显微镜。该型的照明装置配用同一厂生产的显微镜才能发挥效能。另一优点是比分离型紫外漏光少，如配用普通标准型显微镜，装上截止滤光片，也可用于荧光观察，且这样组合的装置价格较便宜。
内装固定型是将光源、照明光学系统、各种滤光板及观察显微镜组成—体，装于坚固的镜体中，是的徕卡荧光显微镜，其光轴更合完善，调整时不必担心偏位，而巳激励光的漏光极少。它是荧光观察中的显微镜，但价格较高。